1. 手術會導致乾眼症
乾眼症是近視雷射手術最常見的併發症，乾眼症的症狀包括疼痛，燒灼感，異物感，刺癢，疼痛等。美國FDA(食品藥物管理局)的網站警告，雷射手術導致的乾眼症可能是永久性的。約20%的病患在手術表示在手術六個月後，乾眼症有「顯著惡化」的趨勢。
2. 雷射手術會折損視覺品質
雷射手病患在夜間或是光線微弱的地方容易看不清事物，根據報告顯示，在雷射手術後6個月，有19.3%的病患抱怨仍有夜間駕駛問題。
3. 角膜在手術後無法完全癒合
雷射角膜手術會將角膜割開，運用雷射調整完水晶體後在蓋上，根據研究人員指出，角膜在手術後並無法完全癒合，正常角膜的角膜瓣拉伸強度約2.4％。但手術完會將大大削弱。
4. 雷射手術有長期後果要承擔
雷射手術會影響眼壓測量的準確性，容易讓病人暴露在因未被診斷出青光眼而喪失的視力風險。而雷射手術後常使用的類固醇的眼藥水，也可能會加速白內障的發生。
5. 雙眼同一天手術風險高
根據2003年美國白內障和屈光手術（ASCRS）協會調查，高達91%的外科醫生，在同一時間幫病人作「雙眼」雷射手術，但其實這存在著雙眼都失明的風險，因為兩眼同時手術危險較分別「單眼」進行為高。
6. 手術後其他嚴重的併發症
醫學文獻中許多報告指出，雷射手術將引起許多「遲發性的併發症」，包含角膜感染、皮瓣脫落、角膜霧狀混濁、視網膜脫離等，這些危及視力的風險都可能再數月或數年後才出現。
7. 雷射手術並未免除戴眼鏡的需要
雷射手術並不能保證病人在40歲後仍然可以不戴眼鏡閱讀，根據研究顯示，病人手術後的視力會隨著時間減弱，最終仍可能須重新戴上眼鏡。
8. 雷射手術併發症真實發生機率仍未知
現今仍未有任何手術併發症的相關報告，而有些併發症如「乾眼」及「夜間視力減弱」只被歸為症狀，而非「併發症」，顯示醫界對於「併發症」的定義仍未達成共識。
9. 雷射手術後併發症治療選擇有限
雷射手術對於併發症的治療方案極為有限，通常會選擇佩戴硬性隱形眼鏡供視力的改善，但因雷射手術後隱形眼鏡驗配過程既費時且昂貴，許多患者最終選擇放棄。
10. 眼鏡和隱形眼鏡相對安全
一些外科醫生已放棄進行手術，因為雷射手術最終只是一種選擇性治療，病患沒有充分理由，不須冒著視力損失的風險，眼鏡和隱形眼鏡才是最安全的替代品。
